Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn18P56857 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn18P56857 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms