Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5bP56480 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5bP56480 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms