Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp5P56399 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms