Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NcanP55066 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NcanP55066 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NcanP55066 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NcanP55066 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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NcanP55066 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NcanP55066 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NcanP55066 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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