Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ephb3P54754 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ephb3P54754 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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