Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23aP54726 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms