Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacnb3P54285 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms