Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dbx1P52950 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dbx1P52950 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dbx1P52950 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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