Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcnfP51944 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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