Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TspoP50637 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TspoP50637 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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