Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SftpbP50405 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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