Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LtbrP50284 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms