Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdhaP50136 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdhaP50136 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BckdhaP50136 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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BckdhaP50136 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms