Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HpdP49429 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HpdP49429 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HpdP49429 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HpdP49429 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HpdP49429 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HpdP49429 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HpdP49429 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HpdP49429 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms