Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp3P49194 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms