Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CitP49025 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CitP49025 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CitP49025 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CitP49025 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CitP49025 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms