Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx2P48379 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms