Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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