Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms