Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms