Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx1-2P42580 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx1-2P42580 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nkx1-2P42580 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms