Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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