Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms