Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6dP35459 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms