Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms