Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms