Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnar1P33896 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifnar1P33896 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms