Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms