Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VtnP29788 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VtnP29788 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VtnP29788 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms