Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb9P28076 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms