Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CftrP26361 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CftrP26361 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CftrP26361 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CftrP26361 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CftrP26361 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CftrP26361 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms