Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChgaP26339 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms