Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd12P23812 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd12P23812 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms