Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd8P23463 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms