Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ggta1P23336 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ggta1P23336 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ggta1P23336 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ggta1P23336 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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