Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RarbP22605 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RarbP22605 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms