Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc2P20801 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms