Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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