Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka1P18653 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms