Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpraP18052 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms