Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Defa-rs1P17533 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa-rs1P17533 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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