Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pou4f1P17208 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou4f1P17208 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms