Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrm1P12657 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrm1P12657 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms