Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P10404 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P10404 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P10404 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms