Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxb4P10284 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb4P10284 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms