Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CatspereP0DP43 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CatspereP0DP43 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms