Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Tmem254bP0DN90 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms