Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Surf1P09925 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms