Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb1P09055 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb1P09055 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb1P09055 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb1P09055 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb1P09055 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms