Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06334 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06334 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06334 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P06334 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms